Научная деятельность связана с исследованиями свойств легких ядер (в том числе нейтроноизбыточных), обусловленных их важным значением в ядерной астрофизике и термоядерных реакциях. Основные результаты исследований вошли в международную библиотеку ядерных данных SaBa (г.Саров, Россия), модернизированную и дополненную в рамках совместного проекта ИЯФ НЯЦ РК и Российского Федерального Ядерного Центра - Всероссийского научно-исследовательского института экспериментальной физики.
Научная деятельность связана с исследованиями структура легких экзотических ядер, гало ядер, взаимодействий легких заряженных частиц с ядрами 1р оболочки, кластерных состояния легких ядер.
Ермаков Евгений Леонидович занимает должность начальника научно-технического центра неразрушающих методов контроля (НТЦ НМКИ) с 18 июня 2007 года. Основная область деятельности связана с управлением и развитием деятельности НТЦ НМКИ, разработкой программ обучения и аттестации, организацией и проведением курсов профессиональной подготовки персонала по неразрушающим методам контроля. Практическая и исследовательская работа направлена на применение и развитие методов неразрушающего контроля для оценки работоспособности промышленного оборудования и трубопроводов, объектов атомной энергетики.