Бекбаев А.К. автор и соавтор свыше 30 научных работ, в том числе 15 работ, входящих в список Web of Science и Scopus.
С 2010 г. работает в тесном сотрудничестве с учеными из известных ядерных центров мира: Объединённый институт ядерных исследований (г. Дубна, Россия), Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf (г.Дюссельдорф, Германия).
